1. 計畫申請
   • 受理單位：農會、公所
   • 檢附資料：
     • 產業生產設施與設備計畫申請表
     • 產銷履歷／有機驗證／溯源農糧產品追溯條碼／國際驗證(GLOBALG.A.P等) ／外銷切花切葉系統性管理作業規範驗證
     • 本年或前一年度自行或配合主管機關農藥殘留抽檢合格報告
     • 本年或前一年度相關契作契約或供應實績證明文件，另花卉產業依規範辧理
     • 土地資料及合法使用文件(承租土地者應檢附租約及設置溫網室同意書等文件)
     • 種苗業登記證(申請種苗項目填寫)
     • 配合大宗蔬菜種苗供應申報(申請種苗產業填寫，由系統勾稽)
     • 外銷供應實績(申請果樹、花卉產業文心蘭項目填寫)
2. 資料查核
   • 受理單位：分署、縣市政府
3. 計畫執行
   • 受理單位：分署、縣市政府
4. 驗收
   • 受理單位：分署、縣市政府
5. 請/撥款
   • 受理單位：分署、縣市政府

【審查評分優先順序】

(一)共同規定：

1. 本次申請補助案前3年未獲本計畫補助設施與設備者優先納入。
2. 本次申請補助案前1年申請者辦理經費保留或放棄執行者暫不列入補助對象，俟經費有賸餘再列入排序。
3.接受所在地直轄市、縣市政府專案輔導及配合農業部所屬農業試驗改良場所辦理試驗，以個案審認方式辦理，不列入排序。

(二)蔬菜產業

1.參與蔬菜集團產區者。
2.通過產銷履歷、有機驗證(含有機轉型期)蔬菜品項者。
3.契作契銷之蔬菜農民。
4.汛期（5月至10月）、颱風或豪雨期間，具供應蔬菜至果菜批發市場運銷實績。
5.落實作物安全自主管理，提出農藥自主送驗合格報告之農民。
6.種植蔬菜類別以葉菜類、根莖菜類及蔬菜用瓜果類。

(三)果樹產業

1.登錄外銷作物生產供應鏈審查合格之農民。
2.參與果樹集團產區者。
3.通過產銷履歷、有機驗證(含有機轉型期)水果品項者。
4.種植鳯梨、芒果、番石榴及柑橘類等具外銷潛力果品之農民。
5.落實水果安全自主管理，提出農藥自主送驗合格報告之農民。

(四)花卉產業

1.以通過「外銷切花切葉系統性管理作業規範」驗證者或國際認驗證（如GLOBALG.A.P.、MPS等）者優先（須提供通過驗證之證明文件）。
2.種植國內育成之品種者優先。（提出合法種植具品種權或品種權申請中品種之證明）
3.文心蘭申請雙層錏管網室者以汰舊換新為限（原址重蓋或舊地拆除移地重建），可提供前2年實施產期調節具分散產期供貨證明且前2年外銷實績為持續成長者，或與出口業者簽訂外銷日本以外其他國家市場(敘明國別)之銷售契約達3年以上者，不受汰舊換新限制。

(五)種苗產業

1.從事蔬菜採種或育種之種苗業者。
2.參與香蕉、柑橘、百香果、草莓等健康種苗驗證體系者。
3.配合參與大宗蔬菜種苗供應申報者。
(六)菇類產業
1.通過產銷履歷、有機驗證(含有機轉型期)香菇、木耳、草菇品項者。
2.契作契銷之菇類栽培農民。
3.落實作物安全自主管理，提出農藥自主送驗合格報告之農民。

【申請方式、審查及實施程序】

(一)由農糧署或農糧署轄區分署視經費運用情形，函請直轄市、縣市政府(以下簡稱地方政府)通知所轄農民團體、鄉鎮市區公所及種苗產業公協會（以下簡稱執行單位）（併副知農糧署轄區分署）調查設施及設備需求，並輔導符合本規範受補助對象填具申請表（附表1），由執行單位彙整轄區申辦案件清冊（附表2），函送地方政府並副知農糧署轄區分署。
(二)由地方政府彙整所轄執行單位申請案，並檢視申請書件後，符合本規範案件函送農糧署轄區分署，資料不齊者不予受理。
(三)由農糧署轄區分署逕行審核，得依審核需要請申請者提供溫網室配置圖、產品相關資訊或使用規劃，並得視申請案件多寡及實際需要，邀集地方政府、改良場所進行審查（必要時得實地勘查），視預算額度，依評選成績、意見及補助優先順序，擇定補助對象。
(四)由農糧署轄區分署將審查通過清冊（附表3）函送所轄地方政府，為加速計畫執行，由地方政府函所轄執行單位通知受補助對象依據審查通過項目覈實辦理，並請地方政府研提計畫說明書送農糧署轄區分署核定。
(五)由農糧署轄區分署依經費運用及業務需求，自行分批辦理受理申請及審查作業，並由農糧署轄區分署統籌所轄經費使用情形。
(六)本計畫名稱統一依照縣市與產業別訂之，如「○○年雲林縣蔬菜產業生產設施與設備計畫」，同一產業後續計畫則加上數字（二），以此類推。

(七)設施施工規定

1.施工前期：

(1)由執行單位利用具備衛星定位之相機、行動載具（如手機等）拍攝具設施座落土地座標照片或邀集申請人勘查拍攝搭建設施用地現況照片，並填寫用地興設會勘表（附表4），確認搭建設施用地為新建用地；執行單位得視實際需要邀集地方政府或農糧署轄區分署進行現場勘查。
(2)倘設施（備）配合設施搭建期程及農時耕作需求，於計畫尚未審查通過前，得於送案申請時敍明原因、併提具切結，並由執行單位確認為新品者可先行施作，惟實際核定結果（申請項目審查通過與否、補助比例及設置面積或數量等），須由申請人自行承擔。務請執行單位明確告知申請者。

2.施工中期：

(1)由執行單位勘查拍照留存。
(2)農業部水土保持服務團輔導農戶開挖放樣、按圖施工作業，係屬依農民需求申辦之彈性輔導機制，倘需申請水土保持服務團現場諮詢輔導者，得依程序向直轄市、縣（市）政府提出申請。

3.完工後：執行單位辦理驗收後（驗收紀錄包括驗收時間、地點、設施種類面積、驗收結果、驗收人員、監驗人員等項目）（附表5），聯繫直轄市、縣（市）政府或農糧署轄區分署辦理計畫成果會勘（附表6），確認為整體設施項目（骨架、塑膠布等）皆需為新品。

(八)設備施工規定

1.施工前：附屬於生產設施之設備由執行單位依設施施工前期會勘程序辦理，於欲設置位置拍照確認尚未施作。倘與設施同時設置者，按設施施工規定辦理。
2.完工後：由執行單位辦理驗收，確認整體為新品，得視需要聯繫地方政府或農糧署轄區分署會勘。

(九)申請補助設施興建具固定基礎者，應依農業用地作農業設施容許使用規定申請；涉及建築行為者，應依相關法規辦理，申請設備者應設置於合法生產設施。
(十)補助之設施及設備必須為計畫辦理期間購置之新品，不得以舊品充當新品核銷，違反規定者應繳回全部補助款，該申請人不再予以補助。
(十一)計畫執行期間，由直轄市及縣（市）政府督導受補助對象確實依據計畫核定進度辦理。
(十二)為利計畫查核，受補助人應於申請項目明顯位置標示「農糧署○○農再-○○-糧-○○補助」（計畫編號）字樣，以字體大小以長寬各5公分為原則（視申請項目大小而定），並以耐用材質設置，另設備標示於明顯處即可。

【經費撥付】：現地查核通過，依規定請撥農糧署補助款及核銷經費；撥付方式，得選擇分次撥付或一次撥付。

(一)地方政府請撥經費：請依農業部主管計畫經費處理作業規定辦理，檢附核銷文件同農民團體請撥經費規定。計畫補助經費逕撥地方政府後，轉撥入所轄公所，再由公所轉撥入轄內受補助對象之帳戶。
(二)農民團體、種苗產業公協會請撥經費（得採下列方式擇一辦理）

1.一次撥付：設施請檢附載明溫網室設施保固條款之合約書影本或設施保固文件、請款領據、補助溫網室設施及設備全額發票影本、施工前會勘表和成果會勘表之影印本、設施照片(施工前期、中期、完工照片各1張)、設備照片(施工前期、完工照片各1張)、具固定基礎之設施檢附農業設施容許使用同意書、補助款核銷清冊（由農業設施溫網室資訊管理平台列印、附表7）。照片請標明受補助農民姓名、搭建地段地號、設施與設備種類及補助面積。設備購置後，由執行單位辦理驗收，確認為新品，始予核銷，由執行單位掣據向農糧署轄區分署請撥。計畫補助經費逕撥農民團體、種苗產業公協會後，再轉撥入轄內受補助對象之帳戶。
2.分期撥付：依農業部主管計畫經費處理作業規定第8點規定，辦理分期請撥。補助經費150萬元以上者，請撥第一期款需檢附請款收據、所有補助對象之施工前會勘表及合約書（須載明保固條款）。申請撥付第二期經費，應俟整體已撥經費執行率達百分之六十以上，始得撥付，需檢附請款收據、全額發票（影本）及成果會勘表（影本）。計畫補助經費逕撥農民團體、種苗產業公協會後，再轉撥入轄內受補助對象之帳戶。
3.本計畫係基金預算，請各執行單位應核實撙節支應並重績效，以符預期效益。

• 補助之設施與設備應維持本計畫目的使用，除因天然災害所致之不可抗力因素外，受補助設施（備）自補助次年度起算應維持最低使用5年年限以上。未達使用年限應移地重建，惟須先經原核定計畫當地分署同意備查。受補助設施(備)，未能維持最低使用年限者，應依第十二點規定辦理。
• 為確保計畫執行成效，各地方政府應邀集農糧署轄區分署及執行單位，辦理受補助興設設施栽種作物及設施(備)樣態情形之查核與輔導，並填寫紀錄表（附表8）。
  

(一)參酌最低使用年限，每年應查核前3年受補助農戶至少1/10或20戶。為利查核輔導，各地方政府得衡實洽請執行單位先行追蹤列冊送府及農糧署轄區分署，以為查核實施時程之安排參據。
(二)地方政府及農糧署轄區分署得隨時派員或會同相關人員抽查、督導及考核計畫所購置之財產，執行單位及受補助對象不得拒絶或隱匿。
(三)經查核發現未依計畫種植目標作物、未依補助用途或其他違反相關規定等情事經改善後，次年度加強追蹤查核。
(四)未依計畫種植目標作物，應予追蹤輔導並作為爾後計畫評選參據。

• 受補助對象獲得本計畫補助，有下列情形之一者，農糧署轄區分署或原核定計畫機關得撤銷或廢止其一部分或全部補助，受補助對象應依第十二點繳回已受領之補助款：
  

(一)違背法令者。
(二)與計畫指定用途不符、未依計畫種植目標作物。
(三)未依計畫有效運用者。
(四)未依計畫用途支用補助款、虛報、浮報之情事，檢附文件有虛偽不實之情事。
(五)規避、妨礙或拒絶地方政府及農糧署轄區分署查核。
(六)經查核有缺失，複查或限期改善仍未改善者。

• 受補助對象違背前點規定及其他規定之處理原則如次：

(一)請地方政府通知執行單位輔導受補助對象於1個月內改善，並副知農糧署轄區分署。 
(二)改善期限屆期後，請地方政府會同農糧署轄區分署再次辦理查核工作，倘未改善者，應請受補助對象陳述意見並切結改善1次（期限以6個月為限），拒絕切結者，得由原核定計畫機關逕依本點第三款函飭受補助對象繳回全部補助款。
(三)經地方政府及農糧署轄區分署查明未依切結期限改善者，依農糧管理計畫研提與管理手冊及農業部主管計畫經費處理作業規定辦理，應由原核定計畫機關依據行政程序法作成書面行政處分，函飭受補助對象限期繳回全部補助款；屆期未返還者，依法移送行政執行，並自查核次年度起停止溫網室設施與設備相關計畫3年補助資格。
(四)經地方政府及農糧署轄區分署查明無法改善者或農民切結無意願改善者，得逕依本點第三款函飭受補助對象繳回全部補助款。
(五)經查核違反本原則相關情事且業輔導改善次數達二次以上，後續查核仍有違規情事者，依本點第三款函飭受補助對象繳回全部補助款。

• 對於受補助設施（備）應盡善良管理人之責任，於第九點記載所訂最低使用年限內發生遺失、失竊等情事，受補助者應向當地警察單位報案協查，並通知執行單位函報直轄市、縣（市）政府及農糧署轄區分署備查。倘無不可抗力因素，自購置後不得擅自轉售或逕自轉讓，並依第十二點追蹤查核及追繳補助款程序辧理。
• 本補助原則未盡事項悉依農業部及農糧署農糧管理計畫研提與管理手冊等相關規定辦理。